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 2020


MSc- defensio online am Mondsee

 defensio-pixabay

Aufgrund der Corona-Sicherheitsauflagen der Universität Innsbruck fand heute die defensio der Masterarbeit von Daniela Frantal online statt. Die Mitwirkenden waren aus Mondsee (Prüferin: D. Lamatsch, Betreuerin und Prüferin: B. Sonntag), Göttingen (Vorsitzernder und Betreuer: T. Pröschold) und Innsbruck (Studierende: D. Frantal) zur defensio zugeschaltet. Trotz der geografischen Entfernung konnte die Masterarbeit mit dem Titel "Integrative Taxonomy: Morphology and Molecular Phylogeny of the Genus Urotricha (Prostomatida, Ciliophora)" mit einem "Sehr gut" verteidigt werden und die Studierende hat damit den Titel "Master of Science" erworben. Wir gratulieren sehr herzlich!

 online seit, 12.08.2020


Junge Uni Innsbruck am Mondsee im Coronajahr 2020 ging zu Ende

Ein Tag im Labor  Ein Tag im Labor2 Ein Tag im Labor3

Fotos S. Wanzenböck, ILIM

Mit zwei Workshops der Jungen Uni Innsbruck "Ein Tag im Labor" am Forschungsinstitut für Limnologie, Mondsee, der Universität Innsbruck an einem Tag geht unser Sommerprogramm für 2020 zu Ende. Das Interesse und die große Geschicklichkeit der 7 bis 9 Jährigen beim Arbeiten im Labor begeisterte Dr. Dunja Lamatsch und Mag. Maria Pichler, die die Workshops abhielten. Die Kinder konnten selbst Erbsubstanz gewinnen und unter fachlicher Anleitung erfahren, welche Geräte und Protokolle im Labor verwendet werden. Der Hintergrund zur Praxis wurde altersgerecht aufbereitet. Die TeilnehmerInnen hielten sich vorbildlich an die strengen Corona-Sicherheitsvorkehrungen der Universität Innsbruck. Wir freuen uns schon auf die Termine im nächsten Jahr - hoffentlich ohne Corona!

online seit 12.08.2020


"Richtiges Trinken" und Trinkwasserqualität des Mondsees" - ein Beitrag in Servus TV

 Trinkwasser
pixabay

In der Sendung Servus am Abend am 6.8.2020 informierte der stv. Institutsleiter assoz. Prof. Dr. Rainer Kurmayer vom Forschungsinstitut für Limnologie der Universität Innsbruck über die "Trinkwasserqualität" des Mondsees und welche Mikroorganismen für die Wasserqualität eines Sees eine Rolle spielen.

zum Servus TV Beitrag Wasser trinken lernen

online seit 07.07.2020


Grosses Interesse an Junge Uni Terminen in Mondsee

Mein eigenes Aquarium2

Der Workshoptermin "Mein eigenes Aquarium" war ausgebucht

Bereits drei Junge Uni Termine haben heuer als Präsenzveranstaltungen am Forschungsinstitut für Limnologie am Mondsee stattgefunden. Obwohl unser Workshop "Leben im Wassertropfen" wegen der Corona-Auflagen gestrichen werden musste, hatten wir uns entschieden, anderen Junge Uni Workshops auch in diesem Sommer durchzuführen. In kleinerer Gruppengröße konnten Kinder zwischen 6 und 15 Jahren (je nach Workshop) mehr über Neobioten erfahren, unter fachlicher Anleitung lernen, wie man ein Aquarium einrichtet und einen Tag im Labor verbringen und selbst für ein paar Stunden zum Forschenden werden. Die Nachfrage, besonders für unseren "Tag im Labor" ist so groß, dass ein zusätzlicher Termin schon wieder ausgebucht ist. Wir bedanken uns für das große Interesse an unseren Aktivitäten.

Mit Beginn des neuen Schuljahrs sind Workshops, Vorträge und Aktivitäten in Kooperation mit fünf Schulen aus der Region im Rahmen des FFG Talente regional Projekts "geniALGE" - Algentechnologie als Zukunftshoffnung geplant. Dabei werden Schülerinnen und Schüler zwischen 7 und 17 Jahren aktiv in das 28 Monate dauernde Projektprogramm eingebunden.

Auch die Lange Nacht der Forschung musste wegen der Coronasituation von 2020 vorläufig auf 23. April 2021 verschoben werden. Zwischen 9. Oktober und 30. Dezember 2020  besteht die Möglichkeit digitale Informationen im Rahmen der Langen Nacht der Forschung abzurufen. Wir hoffen auf eine reibungslose Durchführung aller künftigen Präsenzveranstaltungen am Forschungsinstitut in Mondsee und sind darauf bedacht den strengen Coronavorgaben zu folgen.

online seit 06.08.2020


Neue Publikation am ILIM (MitarbeiterInnen hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff members in bold):

Lu X., Wang Y., Al-Farraj S.A., El-Serehy H., Huang J., Shao C. (2020). The insights into the systematic relationship of Gastrostyla-affinitive genera, with report on a new saline soil ciliate genus and new species (Protozoa, Ciliophora). BMC Evol Biol 20:92 https://doi.org/10.1186/s12862-020-01659-8

Background

Hypotrichia are a group with the most complex morphology and morphogenesis within the ciliated protists. The classification of Gastrostyla-like species, a taxonomically difficult group of hypotrichs with a common ventral cirral pattern but various dorsal and ontogenetic patterns, is poorly understood. Hence, systematic relationships within this group and with other taxa in the subclass Hypotrichia remain unresolved.

Results

18S rRNA gene sequence of a new Gastrostyla-like taxon was obtained. Phylogenetic analyses based on the 18S rRNA gene sequences indicate that this ciliate represents a new genus that is closely related to Heterourosomoida and Kleinstyla within the oxytrichid clade of the Hypotrichia. However, the position of this cluster remains unresolved. All three genera deviate from the typical oxytrichids by their incomplete (or lack of) dorsal kinety fragmentation during morphogenesis. Morphology and morphogenesis of this newly discovered form, Heterogastrostyla salina nov. gen., nov. spec., are described. Heterogastrostyla nov. gen., is characterised as follows: more than 18 fronto-ventral-transverse cirri, cirral anlagen V and VI develop pretransverse cirri, and dorsal ciliature in Urosomoida-like pattern.

Conclusions

Similar to the CEUU-hypothesis about convergent evolution of urostylids and uroleptids, we speculate that the shared ventral cirral patterns of Gastrostyla-like taxa might have resulted from convergent evolution.


Neue Publikation am ILIM (MitarbeiterInnen hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff members in bold):

Pitt A., Koll U., Schmidt J., Hahn M. W. (2020). Aquirufa ecclesiirivi sp. nov. and Aquirufa beregesia sp. nov., isolated from a small creek and classification of Allopseudarcicella aquatilis as a later heterotypic synonym of Aquirufa nivalisilvae. Int J Syst Evol Microbiol (online first) https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004319

 

Two bacterial strains, 50A-KIRBAT and 50C-KIRBAT, were isolated from the same freshwater creek located near Salzburg, Austria. They showed 16S rRNA gene sequence similarities to of 100 and 99.9 %, respectively. A genome-based phylogenetic reconstruction with amino acid sequences of 119 single-copy genes suggested that the new strains represent two new species of the genus . Pairwise calculated whole-genome average nucleotide identity (gANI) values ranging from 85.4 to 87.5 % confirmed this conclusion. Phenotypic, chemotaxonomic and genomic traits were investigated. Like strains of other species, 50A-KIRBAT and 50C-KIRBAT grew aerobically and chemoorganotrophically, were rod-shaped, red-pigmented and motile, most likely by gliding. They could be distinguished by slight differences in the chemotaxonomic features. We propose to establish for strain 50A-KIRBAT (=CIP 111735T=LMG 31080T) as type strain the name and for strain 50C-KIRBAT (=CIP 111736T=LMG 31501T) as type strain the name . Furthermore, the relationship between the type strains of (59G-WUEMPELT) and (HME7025T) was investigated. Results of polyphasic analyses, especially a gANI value of 97.6 %, as well as the genome-based phylogenetic reconstruction, suggested that is a heterotypic synonym of . According to rule 24b of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes we propose to classify strain HME7025 as and provide an emended description for the latter.

This study was supported by ‘Sparkling Science’ project SPA 06/065 funded by the Austrian Federal Ministry of Education, Science and Research (BMBWF) and the program ‘Talente’ of the Austrian Research Promotion Agency (FFG).


SIL-News Artikel zum Tonolli Memorial Award 2017 von Benard M. Simyu

SIL-News19 SIL-News20

Die aktuelle Ausgabe der SIL-News hat unseren PhD Studierenden Benard M. Simiyu den Artikel "The effects of reopening Mbita channel on eutrophication in Nyanza Gulf of Lake Victoria, Kenya", zu Ehren der Verleihung des Tonolli Memorial Awards 2017 gewidmet. Benard präsentiert hier einen Teil seiner Dissertation, die vom Forschungsgruppenleiter Rainer Kurmayer vom Forschungsinstitut für Limnologie, Mondsee, der Universität Innsbruck betreut wird.

online seit, 15.07.2020


Auszeichnung für PostDoc in Mondsee

YoungAuthorAward-2020 TS

Für seine Publikation "Asexual reproduction changes predator population dynamics in a life predator-prey system" in der Zeitschrift Population Ecology, hat der PostDoc Thomas Scheuerl den Young Author Award 2020 der Society of Population Ecology erhalten. Die Publikation ist als open access verfügbar und in Zusammenarbeit mit dem Forschungsgruppenleiter Claus-Peter Stelzer erschienen. Wir gratulieren sehr herzlich!

online seit, 10.07.2020


FFG Talente regional Projekt geniALGE startet am 1.7.2020 mit neuer Webseite

Webseite-geniALGELogo geniALGE

Heute startet unser FFG Talente regional Projekt geniALGE und unsere Projektwebseite geht online. Unter https://genialge.at/ gibt es Aktuelles, Wissenswertes und Berichte über unsere Projektaktivitäten. Außerdem findet ihr spannende Links zu u. a. Experimenten und Kochrezepte mit Algen. Die Infos werden laufend erweitert, also immer wieder einmal reinklicken! Zehn Kooperationsprojekte zum Thema Algen bzw. Klimawandel können im Projektzeitraum bei der Projektleitung eingereicht werden. Wir empfehlen auch den Besuch unseres geniALGE Instagram Accounts. Los gehts! 😎💪 

online seit 01.07.2020

 


Neue Publikation am ILIM (MitarbeiterIn hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff member in bold):

Sonntag B., Sommaruga R. (2020). Effectiveness of Photoprotective Strategies in Three Mixotrophic Planktonic Ciliate Species. Diversity 12:252, doi.10.3390/d12060252

Mixotrophic ciliate assemblages often prevail in summer in the surface layers of lakes. During this time, they are potentially exposed to damaging levels of incident solar ultraviolet radiation (UVR) and need efficient photoprotective mechanisms to minimize the damage. Herein, we tested the algal-bearing species of Pelagodileptus trachelioides, Stokesia vernalis, and Vorticella chlorellata for how they handled stress under exposure to the artificial sunlight spectrum (i.e., UV treatment), just photosynthetically active radiation (PAR), or in the dark (i.e., control). In addition to measurements of their survival, changes in behavior, shape, and whether dark or photoenzymatic repair (PER) mechanisms are present, we measured the concentration of UV-absorbing compounds (i.e., mycosporine-like amino acids). In contrast to the response in the PAR and dark treatments, sublethal effects were observed in all species when exposed to UVR. A wavelength-specific test for P. trachelioides revealed that UV-B was especially lethal. These results suggest that the photoprotective mechanisms found in these ciliates are not sufficient to allow for their survival directly at the surface and that, accordingly, they need to shift their position further down in the water column.


Neue Publikation am ILIM (MitarbeiterInnen hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff members in bold):

Spanner C., Darienko T., Biehler T., Sonntag B., Pröschold T. (2020). Endosymbiotic green algae in Paramecium bursaria: A new isolation method and a simple diagnostic PCR approach for the identification, diversity 12(6):240 doi:10.3390/d12060240  

Paramecium bursaria is a single-celled model organism for studying endosymbiosis among ciliates and green algae. Most strains of P. bursaria bear either Chlorella variabilis or Micractinium conductrix as endosymbionts. Both algal genera are unicellular green algae characterized by cup-shaped chloroplasts containing a single pyrenoid and reproduction by autospores. Due to their size and only few morphological characteristics, these green algae are very difficult to discriminate by microscopy only. Their cultivation is laborious and often unsuccessful, but we developed a three-step isolation method, which provided axenic cultures of endosymbionts. In addition to the time-consuming isolation, we developed a simple diagnostic PCR identification method using specific primers for C. variabilis and M. conductrix that provided reliable results. One advantage of this approach was that the algae do not have to be isolated from their host. For a comparative study, we investigated 19 strains of P. bursaria from all over the world (new isolates and available laboratory strains) belonging to the five known syngens (R1–R5). Six European ciliate strains belonging to syngens R1 and R2 bore M. conductrix as endosymbiont whereas C. variabilis was discovered in syngens R1–R5 having worldwide origins. Our results reveal the first evidence of C. variabilis as endosymbiont in P. bursaria in Europe.


Neue Publikation am ILIM/new publication at ILIM:

Dokulil M.T. & Qian K. (online first). Photosynthesis, carbon acquisition and primary productivity of phytoplankton: a review dedicated to Colin Reynolds, Hydrobiologica

The review intends to give an overview on developments, success, results of photosynthetic research and on primary productivity of algae both freshwater and marine with emphasis on more recent discoveries. Methods and techniques are briefly outlined focusing on latest improvements. Light harvesting and carbon acquisition are evaluated as a basis of regional and global primary productivity and algal growth. Thereafter, long-time series, remote sensing and river production are exemplified and linked to the potential effects of climate change. Lastly, the synthesis seeks to put the life achievements of Colin S. Reynolds into context of the subject review.


Logo Junge Uni

Der schlaue Fuchs der Jungen Uni ist wieder in Mondsee unterwegs

Trotz eingeschränkter TeilnehmerInnenzahl und strikten Hygiene- und Sicherheitsvorkehrungen finden vier Junge Uni Termine im Sommer 2020 am Forschungsinstitut für Limnologie in Mondsee statt.

Von den Aliens in unseren Gewässern über die Anleitung fürs Einrichten eines Aquariums bis zum Tag im Labor könnt ihr an vier Nachmittagen dabei sein.

Hier die genauen Termine, Kosten EUR 8,- pro TeilnehmerIn:

Gibt es Aliens in unseren Gewässern?
13.07.2020 13-15 Uhr,
6-12 Jahre, max 8 Kinder

Mein eigenes Aquarium 1
16.07.2020 13-15 Uhr,
ab 10 Jahren, max 6 Kinder

Mein eigenes Aquarium 2
29.07.2020 13-15 Uhr,
ab 10 Jahren, max 6 Kinder

Ein Tag im Labor
11.08.2020 13-15 Uhr,
ab 8 Jahren, max 6 Kinder

Wir freuen uns schon auf euch!

ANMELDUNG: Die Zahl der Teilnehmer und Teilnehmerinnen für alle Termine begrenzt, bitte melden Sie sich daher rechtzeitig an: Tourismusverband MondSeeLand, bis spätestens am Vortag der Veranstaltung um 16:00 Uhr, Tel. +43 (0)6232 2270 oder info@mondsee.at.

 Bitte beachten: Wir legen größten Wert darauf die Hygiene- uns Sicherheitsvorkehrungen der Universität Innsbruck hinsichtlich Covid-19 bei unseren Veranstaltungen einzuhalten! Daher sind wir verpflichtet eine TeilnehmerInnenliste für unsere Workshops zu führen. Wir bitten die Eltern nur gesunde Kinder für unsere Veranstaltungen anzumelden!!

Die Eltern erhalten bei Anmeldung der Kinder ein Informationsblatt, was im Falle einer Covid-19 Erkrankung ihres Kindes, nach dem Besuch einer unserer Veranstaltungen, zu tun ist. Die Kenntnisnahme dieses Informationsblattes muss durch die Unterschrift eines Elternteils bestätigt und das Blatt an uns retourniert werden! Vielen Dank für Ihr Verständnis!

Im Rahmen dieser Veranstaltungen können Fotografien und/oder Filme erstellt werden. Mit der Teilnahme an der Veranstaltung nehmen die TeilnehmerInnen zur Kenntnis, dass Fotografien und Videomaterialien, auf denen sie abgebildet sind, zur Presse-Berichterstattung verwendet und in verschiedensten (sozialen) Medien, Publikationen und auf Webseiten der Universität Innsbruck veröffentlicht werden. Weitere Informationen zum Datenschutz entnehmen Sie bitte unserer Datenschutzerklärung unter www.uibk.ac.at/datenschutz. Wenn Sie nicht zustimmen, dass Ihre Kinder auf Fotos abgebildet werden, dann informieren Sie uns bitte umgehend zu Beginn der Veranstaltung!

 

online seit 09.06.2020


Wasserqualität der österreichischen Badegewässer EU weit an zweiter Stelle

Hintersteinersee-pixabay

Foto: Hintersteinersee, pixabay Marcocarli

Der aktuelle EU Badewasserbericht ist ab sofort verfügbar. Österreich hat darin mit der Silbermedaille abgeschnitten. Der Bericht bestätigt damit die ausgezeichnete Badewasserqualität in Österreich. So sind von den insgesamt 261 untersuchten heimischen Badestellen 99,6 % (260 Stellen) als „ausgezeichnet“ oder „gut“ eingestuft. 100 Prozent der heimischen Badestellen halten die strengen EU-Vorgaben ein.

Zum Bericht

online seit, 08.06.2020


Schüler und Schülerinnen tauchen in die geniale Welt der Algen ein

geniALGE-Projektteam-2020Blutregenalge

links: Projektverantwortliche S. Wanzenböck und M. Ellmauer (Foto: ILIM), rechts: Blutregenalge (Foto: T. Pröschold)

Algen gehören zu den ältesten Lebewesen auf unserer Erde und existieren in einer großen Artenvielfalt in den Meeren und im Süßwasser. Manche Menschen kennen Algen aber nur als lästige, grüne Watten, die im sommerlichen Badesee das Urlaubsvergnügen schmälern. Dabei ist für diese Überdüngungen meist der Mensch selbst verantwortlich. Weniger bekannt ist, dass Algen weltweit den meisten Sauerstoff von allen Organismen liefern und so unser Leben erst möglich machen. Algen sind genial, weil sie äußerst anpassungsfähig sind und eine wichtige, teilweise noch unerforschte Rohstoffquelle für die unterschiedlichsten Anwendungen darstellen.

Das neue Kooperationsprojekt geniALGE rückt daher diese wichtige Rolle von Algen in der Umwelt und als wertvolle, erneuerbare Rohstoffe für Ernährung, Gesundheit, Landwirtschaft und Energie in den Mittelpunkt. Nach dem erfolgreichen Projekt „Wasserleben“ wird auch dieses Projekt vom Forschungsinstitut für Limnologie der Universität Innsbruck geleitet und gemeinsam mit dem Technologiezentrum Mondseeland koordiniert. Schülerinnen und Schüler aus fünf Schulen der Region Mondsee/Salzburg sind in die einzelnen Prozessschritte des Projekts aktiv eingebunden. Dabei arbeiten sie mit der Blutregenalge (Haematococcus pluvialis), einer kugeligen Mikroalge, die in der Region vorkommt. Ihre Besonderheit ist, dass sie durch den Farbstoff Astaxanthin ihre Färbung von grün bis knallrot wechseln kann, was ihren Namen erklärt.

Kinder und Jugendliche lernen die Vielfalt und Nutzung von Algen kennen

Volksschüler in Unterach und Tiefgraben-St. Lorenz (TILO) sammeln die Algen in der Umgebung ihrer Schulen, Kinder die Neuen Mittelschulen in Mondsee kultivieren und züchten die Algen mit einer vom BORG Straßwalchen entwickelten Nährstofflösung und geben diese Kulturen weiter an die Schülerinnen und Schüler der HBLA Ursprung, die mit der Entwicklung und dem Bau eines Algenreaktors den Projektzyklus abschließen. Begleitet werden die Kinder und Jugendlichen während des Projekts von Wissenschaftlern des universitären Forschungsinstituts in Mondsee (T. Pröschold), einem Experten für Biokunststoffe (Lackner Ventures & Consulting GmbH), einer Ernährungswissenschafterin (Julika) und einem Fachmann für technischen Umweltschutz (pro-wel). Exkursionen in eine Algenproduktionsanlage (ecoduna) werden ebenso angeboten wie Aktivitäten in Kooperation mit dem Klimabündnis Oberösterreich.

Eigene Projektideen zu geniALGE werden gefördert

Ab 1. Juli können zusätzlich 10 Kooperationsprojekte zum Thema Algen und Klimawandel für Kindergärten und Schulen zu je EUR 1000,- gefördert werden. Melden Sie sich per Mail mit Ihren eigenen Projektideen im Antragsformular direkt bei projekt@genialge.at.

Das Projekt wurde im Rahmen der Aktion Talente regional von der Forschungsförderungsgesellschaft (FFG) und dem Bundesministerium für Klimaschutz, Umwelt, Energie, Mobilität, Innovation und Technologie (BMK) aus mehr als 80 Projektanträgen ausgewählt und mit einer Förderung von rund EUR 130.000,- für 28 Monate bewilligt.

Logo FFG Web-1

online seit 02.06.2020


Neue Publikation am ILIM (Mitarbeiter hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff member in bold):

Wanzenböck J., Kubečka J., Sajdlova Z., Frouzova J. (2020). Hydroacoustic target strength vs. fish length revisited: Data of caged, free-swimming European whitefish (Coregonus lavaretus L.) suggest a bi-phasic linear relationship under a limited range of tilt angles Fisheries Research, Fisheries Research 229:105620 https://doi.org/10.1016/j.fishres.2020.105620  

To develop specific target strength (TS) - fish length relationships using 38 kHz and 120 kHz split beam echosounders, we measured TS (dB) in five size groups (5−59 cm total length) of European whitefish (Coregonus lavaretus) swimming freely in a net cage of 4 m diameter and 8 m height. For 120 kHz, we deployed down-looking (dorsal aspect) as well as upwards-looking (ventral aspect) transducers, whereas 38 kHz measurements were taken for the dorsal aspect only. The ventral aspect dataset revealed stronger TS values especially for the larger length classes. The dorsal aspect datasets of both frequencies were not significantly different across all lengths and both showed a steep increase of the relationship in small sizes (5−20 cm) which levelled off in the larger sizes (>20 cm). For 120 kHz the slope of a linear regression of TS vs. log fish length was 29.8 for fish between 5−20 cm (much higher than the generally proposed slope of 20), while in fish >20 cm the slope was 10.7 which is far below the generally proposed value. We advocate considering a potential bi-phasic linear regression of the log length – TS relationship for all species whenever a large size range of fish is studied, encompassing significant proportions below and above approximately 20 cm total length.


Neue Publikationen am ILIM (Mitarbeiter hervorgehoben)/new publications at ILIM (staff member in bold):

Pröschold T., Pitsch G., Darienko T. (2020). Micractinium tetrahymenae (Trebouxiophyceae, Chlorophyta), a New Endosymbiont Isolated from Ciliates. Diversity 12:200, https://doi.org/10.3390/d12050200  

Endosymbiosis between coccoid green algae and ciliates are widely distributed and occur in various phylogenetic lineages among the Ciliophora. Most mixotrophic ciliates live in symbiosis with different species and genera of the so-called Chlorella clade (Trebouxiophyceae). The mixotrophic ciliates can be differentiated into two groups: (i) obligate, which always live in symbiosis with such green algae and are rarely algae-free and (ii) facultative, which formed under certain circumstances such as in anoxic environments an association with algae. A case of the facultative endosymbiosis is found in the recently described species of Tetrahymena, T. utriculariae, which lives in the bladder traps of the carnivorous aquatic plant Utricularia reflexa. The green endosymbiont of this ciliate belonged to the genus Micractinium. We characterized the isolated algal strain using an integrative approach and compared it to all described species of this genus. The phylogenetic analyses using complex evolutionary secondary structure-based models revealed that this endosymbiont represents a new species of Micractinium, M. tetrahymenae sp. nov., which was further confirmed by the ITS2/CBC approach.

Pröschold T., Darienko T., Guiry M.D. (2020). Nomenclatural corrections in the green algal genus Deuterostichococcus Pröschold & Darienko (Trebouxiophyceae), Notulae algarum 137

The generic name Deuterostichococcus Pröschold & Darienko was introduced by Pröschold & Darienko (2020: 135) for four species originally included in Stichococcus Nägeli. Included were Stichococcus deasonii Neustupa, Eliás & Sejnohová and S. allas Reisigl, both of which requirefurther nomenclatural clarification.

Pröschold T., Darienko T. (2020). The green puzzle Stichococcus (Trebouxiophyceae, Chlorophyta): New generic and species concept among this widely distributed genus, Phytotaxa 441(2): 113-142 https://doi.org/10.11646/phytotaxa.441.2.2

Abstract: Phylogenetic analyses have revealed that the traditional order Prasiolales, which contains filamentous and pseudoparenchy-matous genera Prasiola and Rosenvingiella with complex life cycle, also contains taxa of more simple morphology such as coccoids like Pseudochlorella and Edaphochlorella or rod-like organisms like Stichococcus and Pseudostichococcus (called Prasiola clade of the Trebouxiophyceae). Recent studies have shown a high biodiversity among these organisms and questioned the traditional generic and species concept. We studied 34 strains assigned as Stichococcus, Pseudostichococcus, Diplosphaera and Desmocococcus. Phylogenetic analyses using a multigene approach revealed that these strains belong to eight independent lineages within the Prasiola clade of the Trebouxiophyceae. For testing if these lineages represent genera, we studied the secondary structures of SSU and ITS rDNA sequences to find genetic synapomorphies. The secondary structure of the V9 region of SSU is diagnostic to support the proposal for separation of eight genera. The complex taxonomic history was summarized and revised. The ITS-2/CBC approach was used for species delimitation. Considering all these results, we revised the genera Stichococcus, Pseudostichococcus, Diplosphaera and Desmococcus and proposed four new genera and four new species for the science community. The usage of the V9 region and the ITS-2 barcodes discovered potential
new species among the Stichococcus-like organisms in culture-independent studies.


FSI (Fish Scene Investigation) - Kriminalistische Fischsuche am Mondsee

 EW-MSc Freiland

Masterstudentin E. Wolf bei der Messung von Wasserwerten
(Temperatur, Sauerstoffgehalt, u.a.) im Freiland. (Bild: S. Wanzenböck)

Das Aufspüren kleinster Spuren von Erbsubstanz (DNA) ist bei den beliebten, amerikanischen CSI-Serien (Crime Scene Investigation) und auch bei der realen Tatort-Spurensicherung von großer Bedeutung. Aber während dort die Analyse der Proben für die Aufklärung von Verbrechen dient, liefert die Analyse von sogenannter eDNA oder UmweltDNA wertvolle Information in der biologischen Forschung.

UmweltDNA-Analyse aus Wasserproben

Die eDNA wird dabei aus Wasserproben gewonnen, die genetische Bruchstücke z.B. von Haut, Schuppen oder Kot der im Wasser lebenden Organismen enthalten. Das genetische Material wird mit einer Datenbank abgeglichen, in der die DNA bekannter Arten wie in einer Bibliothek abrufbar ist. Diese schonende Methode ermöglicht den Nachweis von Organismen durch minimalen Eingriff in den aquatischen Lebensraum.

Wanderaktivität im Europaschutzgebiet

In einem soeben abgeschlossenen, von der Aktion D. Swarovski geförderten Projekt der Universität Innsbruck, galt das besondere Augenmerk den einheimischen Fischarten Seelaube (Alburnus mento) und Rußnase (Vimba vimba). Die beiden Fischarten bewältigen ihre jährlichen Laichwanderungen in der Europaschutzregion Natura 2000 Mond- und Attersee stromaufwärts in die einmündenden Zuflüsse. Im Gegensatz zu Lachsen, die zum Laichen vom Meer in Flüsse ziehen (anadrome Arten) bzw. Aalen, die ihre aus den Flüssen in die Sargassosee (östlich von Florida im Atlantik) wandern um dort zu laichen (katadrome Arten), bleiben die untersuchten potamodromen Arten im Süßwasser und legen meist nur kurze Strecken auf ihrer Laichwanderung zurück.

Unpassierbare Flussabschnitte durch anthropogenen Einfluss

Für die Wanderungen bevorzugen die Fische ein durchgängiges, passierbares Gewässer, bei dem auch vorhandene Nebengewässer für die Fische erreichbar sind. Durch bauliche Eingriffe wie Begradigungen und der Bau von Wehren und Kraftwerken zur Wasserkraftnutzung, ist es in vielen Fließgewässern aber bereits zu massiven Veränderungen des Lebensraumes, Degradation der Flusshabitate bzw. Isolation unpassierbarer Flussabschnitte gekommen. Der Nachweis dieser Fische sowohl im See, als auch in den Zuflüssen spricht für ein, zumindest abschnittweises, intaktes Fließgewässerkontinuum. Ziel der Arbeit sollte es sein eine Methode zur Untersuchung von wandernden Fischpopulationen zu finden, die verlässlich den Fortpflanzungserfolg von Fischarten nachweisen kann, ohne die Fische zu beeinträchtigen.

Schonendes Fischmonitoring

Die Ergebnisse, die im Rahmen einer Masterarbeit am Forschungsinstitut für Limnologie in Mondsee in Kooperation mit dem Institut für Ökologie entstanden sind, wurden bereits in der Fachzeitschrift Scientific Reports publiziert. Dafür wurden Mond- und Attersee, sowie die Zuflüsse Zeller Ache und Seeache nicht nur durch regelmäßige Beobachtungen in den Zuflüssen, sondern auch durch Wasserproben zur Gewinnung von UmweltDNA (eDNA) im Mittelteil und im Unterlauf während der gesamten Laichperiode untersucht. Die Ergebnisse bestätigten die angewandte Methode als praktikables Monitoringinstrument für künftige Populationsuntersuchungen mit minimalem Störfaktor. Es konnten starke Korrelationen zwischen den Kontrollbeobachtungen und den Analysen der UmweltDNA, aus den verschiedenen Flussabschnitten nachgewiesen werden. Nicht nur die Anwesenheit der Fischarten ist durch die eDNA Analysen möglich, durch die Menge der gesammelten genetischen Bruchstücke, kann auch auf eine höhere oder niedrigere Anzahl von Individuen geschlossen werden.

Originalartikel: Thalinger B., Wolf E., Traugott M., Wanzenböck J. (2019). Monitoring spawning migrations of potamodromous fish species via eDNA, Scientific Reports 9: 15388 https://doi.org/10.1038/s41598-019-51398-0

Presseartikel auf der Seite der Universität Innsbruck

Finanzierung des Projekts Nr 261954 Exploring eDNA methods to assess potamodromous fish reproduction durch die Aktion D. Swarovski KG, Förderungsbeiträge für die Universität Innsbruck

Wissenschaftliche Rückfragen:
Univ. Doz. Dr. J. Wanzenböck,
Forschungsinstitut für Limnologie, Mondsee, der Universität Innsbruck
josef.wanzenboeck@uibk.ac.at

online seit 21.04.2020


Nachlese: Citizen Science Konferenz Obergurgl 

 UZ Obergurgl 2019-CSK

Universitätszentrum Obergurgl, Foto: S. Wanzenböck

Im Blog von Österreich forscht, der Plattform für Citizen Science in Österreich, erschienen kürzlich Detailinformationen zur Citizen Science Konferenz, die von 26. bis 28. Juni 2019 im Universitätszentrum in Obergurgl unter dem Motto "Grenzen und Übergänge" stattfand. In motivierender und freundschaftlicher Atmosphäre hatten die TeilnehmerInnen die Gelegenheit Grenzen und Übergänge von und in Citizen Science zu erforschen und den Umgang mit diesen Schnittstellen im Detail kennenzulernen. Elf der präsentierten Beiträge wurden in den Conference Proceedings of the Austrian Citizen Science Conference 2019 veröffentlicht und sind als open access Version in der Zeitschrift Proceedings of Science publiziert worden. Mit dabei der Beitrag "Linking research and science communication by cooperating with school classes", der von den Aktivitäten, Erfahrungen und Ergebnissen innerhalb des Sparkling Science Projekt "The hidden world of bacteria: Exploring the diversity of bacteria in Austrian inland waters: isolation and description of new species" (SPA 06/065), das am Forschungsinstitut für Limnologie in Mondsee durchgeführt wurde, berichtet.

online seit 30.03.2020


Mangelware Wasser - Weltwassertag am 22. März

Forschungsboot am Mondsee

Forschungsboot "Wilhelm Kühnelt" am Mondsee, Foto: ILIM

Der von UN-Water 2003 festgelegte Weltwassertag wird jährlich am 22. März begangen. Jedes Jahr wird ein Schwerpunkt gewählt, der auf Themenbereiche in Bezug auf Wasser hinweisen soll, die besondere Aufmerksamkeit verdienen. Wie wichtig Wasser ist zeigt sich aktuell bei der Bewältigung der Coronakrise, bei der regelmäßiges Hände waschen als eine der wichtigsten Maßnahmen im Kampf gegen das Covid-19 Virus empfohlen wird. Doch viele Menschen weltweit haben keinen Zugang zu sauberem Wasser.
Der Weltwassertag 2020 steht unter dem Motto „Wasser und Klimaschutz“/“Water and climate change“. Durch den Klimawandel und die damit verbundenen Hitzewellen, sowie Bewässerung und Verschmutzung, sind Wasservorräte weltweit in Gefahr. In Europa sind vor allem die Gebiete um das Mittelmeer betroffen, die vermehrt unter der Wasserknappheit durch Dürreperioden und durch verstärkte Nutzung zur Bewässerung von Kulturpflanzen und für die Viehzucht leiden. In Afrika und Australien haben viele Regionen seit jeher mit Wassermangel und Dürre zu kämpfen. Diese Problematik wird durch den Klimawandel noch zusätzlich verschärft und führt regelmäßig zu Konflikten. Die lange andauernden Buschbrände in Australien haben vielen Menschen in diesem Jahr die Dramatik des Klimawandels vor Augen geführt. Auch in Südafrika leiden viele Menschen unter dem Wassermangel, Kapstadt war im Frühjahr 2018 kurz davor den „Day Zero“, also jenen Tag auszurufen, an dem die Wasserreserven der Stadt erschöpft sind. Beispielsweise mahnt das "World Resource Institute" (WRI), dass diese Situation für mehr als 17 weitere Länder ähnlich dramatisch ist.

In Österreich sind wir in der glücklichen Lage ausreichende, saubere Wasserreserven zur Verfügung zu haben. Die Auswirkungen des Klimawandels beeinflussen nicht nur die Wassermenge, sondern durch die Erhöhung der Temperatur in den Gewässern auch die darin lebenden Organismen. In laufenden Projekten am Forschungsinstitut für Limnologie in Mondsee, beschäftigen sich WissenschafterInnen, unter anderem, genau mit dieser Problematik und welche Mechanismen Organismen entwickeln, um sich diesen veränderten Umweltbedingungen anzupassen.

online seit 20.03.2020


Der Schattenfisch

Hundsfische

Hundsfische, Foto: S. Wanzenböck, ILIM

Beinahe kriminalistische Spurensuche wandte Manfred Christ für die Recherche seines Artikels "Der Hundsfisch - eine fabelhafte Geschichte" in der Zeitschrift "lobau-museum" auf. Er berichtet von der abenteuerlichen Geschichte des Hundsfisches  (Umbra krameri) in Österreich und warum dieser den ehemaligen Leiter des Lobaumuseums sein Leben lang begleitet hat. Der Hundsfisch, eine wirtschaftlich nicht genutzte und versteckt lebende Fischart, war in Österreich bereits als ausgestorben gemeldet, bis sie der Fischbiologe Josef Wanzenböck 1992 in den Donauauen wiederentdeckt hat.

online, seit 18.03.2020 
 

Coronavirus - Maßnahmen am Forschungsinstitut für Limnologie, Mondsee

Ab Montag, 16.3.2020, gibt es am Forschungsinstitut für Limnologie, Mondsee, aufgrund der Covid-19 Situation, ausschließlich Notbetrieb. Der Großteil der MitarbeiterInnen arbeitet im homeoffice-Modus, also von zu Hause aus. Nur unbedingt notwendige Arbeiten (Versorgung der Kulturen, Tierhaltung) werden ausschließlich im erforderlichen Ausmaß stattfinden. Wir ersuchen Sie um Verständnis, Sie können uns für nicht aufschiebbare Anfragen per e-Mail kontaktieren. Wir hoffen für Sie und uns alle, dass wir diese Situation gut meistern werden. Alles Gute, bleiben Sie gesund!

online seit 16.03.2020


Neuer Mitarbeiter in Mondsee

SM Werkstatt 

Seit 09.03.2020 unterstützt uns Sebastian Mayer als neuer Kollege mit Schwerpunkt Maschinenbau in der Werkstatt des Forschungsinstituts für Limnologie, Mondsee. Wir freuen uns über die Verstärkung und wünschen ihm viel Spaß und Erfolg am neuen Arbeitsplatz.

online seit 12.03.2020


 


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Lange Nacht der Forschung 2020 auf Herbst verschoben!

Heute wurde bekannt, dass der Termin der Langen Nacht der Forschung auf Freitag, den 9. Oktober 2020, verschoben wird. Die aktuelle, durch das Coronavirus (COVID-19) verursachte Situation, hat diesen Schritt erforderlich gemacht. Die Gesundheit aller Besucher/innen und Aussteller/innen hat für die OrganisatorInnen oberste Priorität. Wir hoffen, dass Sie uns bei der Forschungsnacht in Mondsee am neuen Termin zwischen 17 und 23 Uhr alle gesund und munter besuchen werden!

Weitere Informationen zum neuen Angebot folgen zu einem späteren Zeitpunkt!

Bleiben sie neugierig!

online seit 12.03.2020


FNL7-2020

Unser neuer ForschungsNewsletter ist da!

In diesen Tagen wird unser aktueller ForschungsNewsletter an die Haushalte des Mondseelandes ausgeschickt. In den Beiträgen erfahren Sie, unter anderem, mehr über das Arbeitsgebiet von Prof. Dr. Otto Seppälä, der seit Juli 2019 am Institut die Forschungsgruppe "Aquatische Evolutionsökologie" leitet. Bitte beachten Sie, dass im ForschungsNewsletter noch nicht auf das neue Datum der Langen Nacht der Forschung am 9.10.2020 hingewiesen wird (die Information über die Verschiebung erhielten wir leider erst nach dem Druck).

Wir wünschen spannende Unterhaltung! 

online seit 12.03.2020


LNF 2020 ILIM-Logo

Unser Countdown zur Langen Nacht der Forschung am 8.5.2020 in Mondsee startet heute! Am Sonntag sind es nur mehr 2 Monate dann gibt es zwischen 17 und 23 Uhr zum zweiten Mal spannende Mitmach-Stationen, Workshops, Führungen und Demonstrationen zu Forschung, Technik und Innovation in der Region Mondseeland. Das Forschungsinstitut für Limnologie, Mondsee, ist wieder einer der Hauptstandorte in Mondsee.

Wozu haben Fische eine Schwimmblase und wie kann sie in der Forschung genutzt werden?

Fischsektion

Foto: ILIM

Bei dieser Station des Forschungsinstituts für Limnologie werden die Organe von Fischen live erklärt. Wie groß ist eine Schwimmblase und welche Funktion hat sie überhaupt? Wussten Sie, dass es auch Fische ohne Schwimmblase gibt? Die FischökologInnen nutzen dieses Organ um im See Fische aufzuspüren und die Populationen genauer zu untersuchen.

Mehr dazu erfahren Sie am 8.5. im Forschungsinstitut der Universität Innsbruck, Mondseestrasse 9!
#langenachtderforschung #limnomondsee #uniinnsbruck @Mondseelimnology

online seit 6.3.2020


Wie wir unsere Seen vor dem Klimawandel schützen können

boot-vor-dem-schafberg.jpg

Foto: ILIM

In einem Interview mit den ForschungsgruppenleiterInnen Bettina Sonntag, Rainer Kurmayer und Josef Wanzenböck berichtet der Standard in seinem Artikel über die Risiken, die auf Seen in Zeiten des Klimawandels zukommen und wie man diese möglicherweise noch einschränken kann.

Zum Presseartikel

online seit 04.03.2020


Naturschauspiel: Lila See im Tiroler Füssen

Servus TV hat über einen Weiher in Tirol berichtet, der sich plötzlich lila gefärbt hat. Die mögliche Ursache hat Mikrobiologe Martin Hahn in einem Interview erklärt. Er vermutet, dass es sich dabei um Purpurbakterien handelt, die durch das Verschwinden des Sauerstoffs an die Oberfläche kommen konnten und damit den Weiher lila färbten. Dieses Phänomen kann in kürzester Zeit wieder verschwinden, nämlich dann, wenn der Sauerstoffgehalt im Gewässer wieder steigt.

Zum TV Beitrag

online seit 04.03.2020


Fischinventur mit neuester Technik - Projekt EcoAlps-Water

Der Bayerische Rundfunk hat die deutschen Partner des internationalen EcoAlps-Water Projekts im Herbst 2019 begleitet und ein Video über die Probenahme mittels Netz-, Elektrofischerei und eDNA Probenahme am Starnberger See gedreht. Mit dabei unser PhD Studierender Hans Rund, der seine Doktorarbeit im österreichischen Teil des Projekts erstellt. Die Forschungsgruppenleiter Rainer Kurmayer und Josef Wanzenböck betreuen die Dissertation in Mondsee.

Freilandprobennahme-Rund

Hans Rund bei der Entnahme von eDNA Wasserproben aus dem See, Foto: ILIM

Das Video ist unter https://www.youtube.com/watch?v=m957-HZUztg abrufbar.

#ecoalpswater #interreg #alpinespace

online seit 26.02.2020


Neue Publikation am ILIM (Mitarbeiter hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff member in bold):

Kurmayer R., Entfellner E., Weisse T., Offterdinger M., Rentmeister A., Deng L. (2020). Chemically labeled toxins or bioactive peptides show a heterogeneous intracellular distribution and low spatial overlap with autofluorescence in bloom-forming cyanobacteria. Sci Rep 10, 2781, https://doi.org/10.1038/s41598-020-59381-w

Harmful algal blooms formed by colony-forming cyanobacteria deteriorate water resources by producing cyanotoxins, which frequently occur at high intracellular concentrations. We aimed to localize toxic microcystins (MCs) and bioactive anabaenopeptins (APs) at the subcellular level under noninvasive conditions. Since both metabolites are synthesized nonribosomally, the relaxed specificity of key enzymes catalyzing substrate activation allowed chemical labeling through a standard copper-catalyzed click chemistry reaction. The genera Planktothrix and Microcystis specifically incorporated unnatural amino acids such as N-propargyloxy-carbonyl-L-lysine or O-propargyl-L-tyrosine, resulting in modified AP or MC peptides carrying the incorporated alkyne moiety. The labeled cells were quantitatively differentiated from the unlabeled control cells. MCs and APs occurred intracellularly as distinct entities showing a cell-wide distribution but a lowered spatial overlap with natural autofluorescence. Using the immunofluorescence technique, colocalization with markers of individual organelles was utilized to relate the distribution of labeled MCs to cellular compartments, e.g., using RbcL and FtsZ (cytosol) and PsbA (thylakoids). The colocalization correlation coefficients calculated pairwise between organelles and autofluorescence were highly positive as opposed to the relatively low positive indices derived from labeled MCs. The lower correlation coefficients imply that only a portion of the labeled MC molecules were related spatially to the organelles in the cell.


Neue Publikation am ILIM (Mitarbeiter hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff member in bold):

Erste Untersuchung der Bedeutung von Umwelttreibern, zB. physikalisch-chemische Ursachen, Anwesenheit von Mikroeukaryoten und die geographische Position für die Vielfalt und Verbreitung von Polynucleobacter und Limnohabitans.

Nuy J.K., Hoetzinger M., Hahn M.W., Beisser D., Boenigk J. (2020). Ecological differentiation in two major freshwater bacterial taxa along environmental gradients. Front. Microbiol. 11:154. doi.org/10.3389/fmicb.2020.00154

Polynucleobacter (Burkholderiaceae, Betaproteobacteria) and Limnohabitans (Comamonadaceae, Betaproteobacteria) are abundant freshwater bacteria comprising large genetic and taxonomic diversities, with species adapted to physico-chemically distinct types of freshwater systems. The relative importance of environmental drivers, i.e., physico-chemistry, presence of microeukaryotes and geographic position for the diversity and prevalence has not been investigated for both taxa before. Here, we present the first pan-European study on this topic, comprising 255 freshwater lakes. We investigated Limnohabitans and Polynucleobacter using an amplicon sequencing approach of partial 16S rRNA genes along environmental gradients. We show that physico-chemical factors had the greatest impact on both genera. Analyses on environmental gradients revealed an exceptionally broad ecological spectrum of operational taxonomic units (OTUs). Despite the coarse resolution of the genetic marker, we found OTUs with contrasting environmental preferences within Polynucleobacter and Limnohabitans subclusters. Such an ecological differentiation has been characterized for PnecC and LimC before but was so far unknown for less well studied subclusters such as PnecA and PnecB. Richness and abundance of OTUs are geographically clustered, suggesting that geographic diversity patterns are attributable to region-specific physico-chemical characteristics (e.g., pH and temperature) rather than latitudinal gradients or lake sizes.


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Position of a Laboratory Technician at the Research Department for Limnology, Mondsee, Austria 

We are offering a full-time position of a Laboratory Technician within the project Functional Diversity of Planktonic Ciliates, funded by the Austrian Science Fund (FWF). This project investigates the taxonomic and, in particular, functional diversity of ciliates in freshwater and the ocean. We will perform several sampling campaigns on Austrian and British lakes and use an experimental approach in the laboratory to investigate ciliate responses to food and temperature.

The successful candidate will be responsible for organizing the field campaigns, perform nutrient and zooplankton analyses, stain the ciliate samples with protargol, cultivate the ciliate species for the experimental and molecular work and to assist in the experimental and molecular analyses within this project.

Employment will start as soon as possible and last until September, 2022; prolongation may be possible. Salary level is based upon previous experience and according to FWF project standards (see https://www.fwf.ac.at/en/research-funding/personnel-costs/).

To apply, please send a motivation letter and CV to Thomas Weisse (thomas.weisse@uibk.ac.at) until March 15, 2020.

Further information

online since Feb 10th, 2020


Postdoc/PhD position at the Research Dept. for Limnology, Mondsee, Austria 

We are offering a postdoc position within the project Functional Diversity of Planktonic Ciliates, funded by the Austrian Science Fund (FWF). This project investigates the taxonomic (TDiv) and, in particular, functional diversity (FDiv) of ciliates in freshwater and the ocean. Our analyses of FDiv will be based upon functional traits (FT) that we will define and weight in their relative significance for the ecosystem level using multivariate statistics. We will use an experimental approach (i.e., numerical and functional responses) and semi-mechanistic models to investigate ciliate responses to food and temperature.

The successful candidate will be responsible for compiling and analysing the existing marine and freshwater FT data and analysing ciliate FDiv using advanced statistics in R. He/she will spend ~9 months in the partner laboratory at Liverpool, conducting experimental laboratory work and field work. The position is also open for suitable PhD candidates

Employment will start as soon as possible and last until September, 2022. Salary level is according to FWF project standards (gross salary currently 54,453.00 € p.a. for Postdocs, see https://www.fwf.ac.at/en/research-funding/personnel-costs/).

To apply, please send a motivation letter, CV and contact details oft wo references until March 15, 2020 to Thomas Weisse (thomas.weisse@uibk.ac.at).

Further information

online since Feb 10th, 2020

 


Neue Publikationen am ILIM (Mitarbeiterin hervorgehoben)/new publications at ILIM (staff member in bold):

Pitt A., Schmidt J., Koll U., Hahn M.W. (online first). Rariglobus hedericola gen. nov., sp. nov., belonging to the Verrucomicrobia, isolated from a temperate freshwater habitat. Int J Syst Evol Microbiol https://doi.org/10.1099/ijsem.0.003980

The bacterial strain 53C-WASEF was isolated from a small freshwater ditch located in Eugendorf, Austria. Phylogenetic reconstructions with 16S rRNA gene sequences and genome based, with amino acid sequences obtained from 105 single copy genes, suggested that the strain represents a new genus and a new species within the family , which belongs to the class of the phylum . Comparisons of the 16S rRNA gene sequence of strain 53C-WASEF with those of related type strains revealed a highest sequence similarity of 93.5 % to and of 92.9 % to . Interestingly, phylogentic trees indicated the latter as being the closest known relative of the new strain. Phenotypic, chemotaxonomic and genomic traits were investigated. Cells were observed to be small, spherical, motile and unpigmented, and grew chemoorganotrophically and aerobically. The respiratory quinone was MK-7, the predominant fatty acids were anteiso-C, Cω5 and C. The identified polar lipids were phosphatidylethanolamine, phosphatidylglycerol and diphosphatidylglycerol. Genome sequencing revealed genes putatively encoding for flagella synthesis and cellulose degradation. The genome size was 4.1 Mbp and the G+C content 60.6 mol%. For the new genus and the new species, we propose the name gen. nov., sp. nov. (=CIP 111665T=DSM 109123T).

Weisse T., Moser M. (2020). Light affects picocyanobacterial grazing and growth response of the mixotrophic flagellate Poterioochromonas malhamensis. J. Microbiol. Vol. 58, DOI 10.1007/s12275-020-9567-8

We measured the grazing and growth response of the mixotrophic chrysomonad flagellate Poterioochromonas malhamensis on four closely related picocyanobacterial strains isolated from subalpine lakes in central Europe. The picocyanobacteria represented different pigment types (phycoerythrin-rich, PE, and phycocyanin-rich, PC) and phylogenetic clusters. The grazing experiments were conducted with laboratory cultures acclimated to 10 μmol photon/m2/sec (low light, LL) and 100 μmol photon/m2/sec (moderate light, ML), either in the dark or at four different irradiances ranging from low (6 μmol photon/m2/sec) to high (1,500 μmol photon/m2/ sec) light intensity. Poterioochromonas malhamensis preferred the larger, green PC-rich picocyanobacteria to the smaller, red PE-rich picocyanobacterial, and heterotrophic bacteria. The feeding and growth rates of P. malhamensis were sensitive to the actual light conditions during the experiments; the flagellate performed relatively better in the dark and at LL conditions than at high light intensity. In summary, our results found strain-specific ingestion and growth rates of the flagellate; an effect of the preculturing conditions, and, unexpectedly, a direct adverse effect of high light levels. We conclude that this flagellate may avoid exposure to high surface light intensities commonly encountered in temperate lakes during the summer. 


Projektstudie Hydrobotanik am Mondsee geht zu Ende

 Hydrobotanik

Die KursteilnehmerInnen mit R. Kurmayer (rechts) und Tutorin K. Geir (2. von links), Foto: S. Wanzenböck, ILIM

Heute endet die MSc-Projektstudie Hydrobotanik am Forschungsinstitut für Limnologie, Mondsee. In dieser Lehrveranstaltung lernten die Studierenden mikroskopisch-taxonomische, feldanalytische und molekulare Verfahren für Aufgaben des Gewässermonitorings einzusetzen und zu bewerten. Der Kurs fand unter der Leitung von assoz. Prof. Dr. Rainer Kurmayer, FG Molecular ecology and ecophysiology of algae (cyanobacteria) statt.

online seit 24.01.2020


Erfolgreicher MSc Abschluss

 AB-MSc defensio 2020

v.l.n.r.: T. Pröschold, Vorsitzender, B. Sonntag (Prüferin), A. Beckmann, T. Weisse (Betreuer und Prüfer),
Foto: S. Wanzenböck, ILIM

Astrid Beckmann verteidigte am Freitag, 17.01.2020 in Mondsee ihre Masterarbeit mit dem Titel "Top down - Regulierung der Populationsdynamik planktischer Ciliaten", in der Forschungsgruppe von Thomas Weisse. In ihrer Studie bemerkte sie, dass maximale Wachstumsraten, Ingestionsraten und der Schwellenwert der Nahrungskonzentration bei Vorticella natans im Bereich anderer Süßwasserciliaten liegen. Die Art kommt in verschiedenen Süsswasserökosystemen häufig, aber dennoch in geringerer Dichte als andere Ciliatenarten vor. Sie untersuchte daher den Räuberdruck auf Vorticella natans und kam zu dem Schluss, dass diese Art im untersuchten Lebensraum den größten Teil des Jahres von oben nach unten kontrolliert wird.

online seit, 20.01.2020


 LNF2020

Die Lange Nacht der Forschung findet 2020 zum zweiten Mal in Mondsee statt!

Am 8. Mai 2020 zwischen 17 und 23 Uhr wird das Forschungsinstitut für Limnologie in Mondsee (ILIM) neuerlich für die interessierte Bevölkerung geöffnet. In zahlreichen Stationen der Langen Nacht der Forschung 2020 können sich BesucherInnen aller Altersklassen über die aktuelle Forschungs und innovative Themen informieren. Die Regionalkoordination erfolgt wieder durch das Technolgiezentrum Mondseeland. Neben dem Forschungsinstitut der Universität Innsbruck am Mondsee sind auch wieder Gastinstitutionen und Firmen mit ihren Stationen mit dabei: Das Bundesamt für Wasserwirtschaft, das Kuratorium Pfahlbauten, die LEADER Region FUMO, die Firmen Smart Robotics, die MAS Alzheimerhilfe und Rewellio sind nur einige der Aussteller. Auch Schulen der Region stellen sich mit Stationen vor z.B. das Werkschulheim Felbertal und das BORG Strasswalchen. Vorträge zum Klimawandel, über Analysemöglichkeiten zu Alzheimer und eine Präsentation des ILIM sind ebenfalls in Planung. Neben dem ILIM werden in Mondsee auch die Standorte der BWT Aktiengesellschaft und des Reinhaltungsverbandes Mondsee Irrsee, sowie das Pfahlbau- und Klostermuseum Mondsee durch einen kostenlosen Busshuttle erreichbar sein.

Details folgen!

online seit 17.01.2020


Neue Publikation am ILIM (Mitarbeiterin hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff member in bold):

Darienko T., Rad-Menéndez C., Campbell C., Pröschold T. (online first): Are there any true marine Chlorella species? Molecular phylogenetic assessment and ecology of marine Chlorella-like organisms, including a description of Droopiella gen. nov., Systematics and Biodiversity, DOI: 10.1080/14772000.2019.1690597

Green algal species of spherical cell shape are generally considered to belong to the genus Chlorella, which are mostly freshwater or terrestrial organisms. Phylogenetic studies have shown that this genus is polyphyletic and belongs to different classes. However, until now, only freshwater or terrestrial strains have been studied. Here we investigated 11 strains of ‘marine’ Chlorella deposited in public culture collections, which we studied using an integrative approach. These strains were largely isolated from marine rock pools and brackish estuaries. SSU and ITS regions of the nuclear encoded ribosomal DNA were sequenced, ribosomal secondary structures were analysed and cell morphology, salinity tolerance and reproduction were examined. Our results showed that the marine strains are also of polyphyletic origin. Surprisingly, three marine isolates belong to Chlorella vulgaris according to the phylogenetic analyses, but showed a high phenotypic plasticity. Whereas these strains showed the typical morphology of C. vulgaris under freshwater conditions, they increased the cell shape and formed cell packages under marine conditions. In contrast, the other investigated strains showed no changes after changing the media. Two of the investigated strains belong to the genus Chloroidium, and those remaining represent a new genus, Droopiella.


Neue Publikation am ILIM (Mitarbeiterin hervorgehoben)/new publication at ILIM (staff member in bold):

Pitt A., Koll U., Schmidt J., Hahn M.W. (online first). Fluviispira multicolorata gen. nov., sp. nov. and Silvanigrella paludirubra sp. nov., isolated from freshwater habitats. Int J Syst Evol Microbiol  https://doi.org/10.1099/ijsem.0.003947

 

Strain 33A1-SZDPT was isolated from a small creek located in Puch, Austria. Strain SP-Ram-0.45-NSY-1T was obtained from a small pond located in Schönramer Moor, Germany. 16S rRNA gene sequence similarities between the type strain of , currently the only member of the family , and strains 33A1-SZDPT and SP-Ram-0.45-NSY-1T of 94.1 and 99.1 %, respectively, suggested affiliation of the two strains with this family. Phylogenetic reconstructions with 16S rRNA gene sequences and phylogenomic analyses with amino acid sequences obtained from 103 single-copy genes suggested that the strains represent a new genus and a new species in the case of strain 33A1-SZDPT (=JCM 32978T=DSM 107810T), and a new species within the genus in the case of strain SP-Ram-0.45-NSY-1T (=JCM 32975T=DSM 107809T). Cells of strain 33A1-SZDPT were motile, pleomorphic, purple-pigmented on agar plates, putatively due to violacein, and showed variable pigmentation in liquid media. They grew chemoorganotrophically and aerobically and tolerated salt concentrations up to 1.2 % NaCl (v/w). The genome size of strain 33A1-SZDPT was 3.4 Mbp and the G+C content was 32.2 mol%. For this new genus and new species, we propose the name gen. nov., sp. nov. Cells of strain SP-Ram-0.45-NSY-1T were motile, pleomorphic, red-pigmented and grew chemoorganotrophically and aerobically. They tolerated salt concentrations up to 1.1 % NaCl (v/w). The genome size of strain SP-Ram-0.45-NSY-1T was 3.9 Mbp and the G+C content 29.3 mol%. For the new species within the genus we propose the name sp. nov.

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