Sebastian Hupfauf, PhD
Postdoc
Institut für Mikrobiologie
Technikerstr. 25d
A-6020 Innsbruck
Bauteil V, 1. Stock, Raum 0/519
Tel.: +43 512 507-51326
Mail: Sebastian.hupfauf@uibk.ac.at

Forschungsgebiete
- Bioinformatik
- Anaerobe Vergärung
- Biogas Produktion
- Molekulare Ökologie
- Abwasserepidemiologie
- Next-Generation Sequencing
Projekte
- CoMA – Comparative Microbiome Analysis
- 2strategies4AD - Optimizing anaerobic digestion, a two-strategy approach
- Pflanzenkohle steigert Biogas Ertrag
- Phosphor aus Gärresten (Universität Rostock)
- DeViVa - Deconvolution of Virus Variants
- Coron-A - Abwassermonitoring für Österreich
- Teichfilter - Filteranlage für Koiteich
Lehrveranstaltungen
Publikationen
Liste aller Publikationen
Publikationen 2023
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Wehner, Marco; Kleidorfer, Irene; Whittle, Ingrid; Bischof, Daniela; Bockreis, Anke; Insam, Heribert; Müller, Wolfgang; Hupfauf, Sebastian (2023): Decentralised system for demand-oriented collection of food waste – Assessment of biomethane potential, pathogen development and microbial community structure.
In: Bioresource Technology 376, Nr. 128894. (DOI) (Weblink)
Vorträge 2023
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Konferenzvortrag (auf persönliche Einladung)
- <i>Vortragende/r:</i> Insam, H <i>Co-AutorInnen:</i> Markt, R; Wagner, AOW; Nägele, F; Hupfauf, S; Klammsteiner, T; Payr, M; Rauch, W: SARS-CoV-2-Abwassermonitoring und Zukunftsperspektiven.
11. Reichersberger Umwelttag, Reichersberg, 02.03.2023. (Weblink)
Gastvorträge
Gastvortrag
- <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, Sebastian <i>Co-AutorInnen:</i> Klammsteiner, Thomas; Plattner, Pia; Winkler, Anna; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine M.: Anaerobic digestion - Aspects of renewable energy and circular economy.
Khon Kaen University, Kohn Kaen, 25.01.2023. (Weblink) - <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, Sebastian <i>Co-AutorInnen:</i> Klammsteiner, Thomas; Plattner, Pia; Winkler, Anna; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine M.: Anaerobic digestion - Aspects of renewable energy and circular economy.
Mahasarakham University, Maha Sarakham, 23.01.2023. (Weblink) - <i>Vortragende/r:</i> Klammsteiner, Thomas <i>Co-AutorInnen:</i> Hupfauf, Sebastian; Heussler, Carina D.; Insam, Heribert; Schlick-Steiner, Birgit C.; Steiner, Florian M: Understanding biotic and abiotic dynamics of black solider fly farming.
Mahasarakham University, Maha Sarakham, 17.01.2023. (Weblink) - <i>Vortragende/r:</i> Klammsteiner, Thomas <i>Co-AutorInnen:</i> Hupfauf, Sebastian; Heussler, Carina D.; Insam, Heribert; Schlick-Steiner, Birgit C.; Steiner, Florian M.: Industrial insect farming for waste management and insect microbiome research.
Khon Kaen University, Kohn Kaen, 25.01.2023. (Weblink) - <i>Vortragende/r:</i> Klammsteiner, Thomas <i>Co-AutorInnen:</i> Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert: F4G: Frass for gas – an ASEA-UNINET project.
Mahasarakham University, Maha Sarakham, 24.01.2023.
Publikationen 2022
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Amman, F.; Markt, R.; Endler, L; Hupfauf, S.; Agerer, B.; Schedl, A.; Richter, L.; Zechmeister, M.; Bicher, M.; Heiler, G.; Triska, P.; Thornton, M.; Penz, T.; Senekowitsch, M.; Laine, J.; Keszei, Z.; Klimek, P.; Nägele, F.; Mayr, M.; Daleiden, B.; Steinlechner, M.; Niederstätter, H.; Heidinger, P.; Rauch, W.; Scheffknecht, C.; Vogl, G.; Weichlinger, G.; Wagner, AO.; Slipko, K.; Masseron, A.; Radu, E.; Allerberger, F.; Popper, N.; Bock, C.; Schmid, D.; Oberacher, H.; Kreuzinger, N.; Insam, H.; Bergthaler, A. (2022): Viral variant-resolved wastewater surveillance of SARS-CoV-2 at national scale.
In: Nature Biotechnology 40, S. 1814 - 1822. (DOI) (Weblink) - do Carmo Precci Lopes, Alice; Ebner, Christian; Gerke, Frédéric; Wehner, Marco; Robra, Sabine; Hupfauf, Sebastian; Bockreis, Anke (2022): Residual municipal solid waste as co-substrate at wastewater treatment plants: An assessment of methane yield, dewatering potential and microbial diversity.
In: Science of the Total Environment 804, Nr. 149936. (Volltext) (DOI) (Weblink) - Masebinu, SO; Fanoro, OT; Insam, H; Mbohwa, C; Wagner, AO; Markt, R; Hupfauf, S (2022): Can the addition of biochar improve the performance of biogas digesters operated at 45°C?
In: Environmental Engineering Research 27/2, No. 200648. (DOI) (Weblink) - Walter, Andreas; Hanser, Maria; Ebner, Christian; Insam, Heribert; Markt, Rudolf; Hupfauf, Sebastian; Probst, Maraike (2022): Stability of the Anaerobic Digestion Process during Switch from Parallel to Serial Operation—A Microbiome Study.
In: Sustainability 14/12, No. 7161. (DOI) (Weblink)
Medienbeiträge
Beitrag in Zeitung
- Hupfauf, S; Etemadi, M; Insam, H; Podmirseg, S.M: DNA-Sequenzierung für Einsteiger und Profis.
In: Newsroom - www.uibk.ac.at vom 11.02.2022. (Weblink)
Vorträge 2022
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Posterpräsentation
- <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, S <i>Co-AutorInnen:</i> Amman, F; Insam, H; Wagner, A.O; Markt, R: DeViVa – Deconvolution of Virus Variants.
Abschlussmeeting Projekt Schulstandortmonitoring, Wien, 30.05.2022. - <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, S <i>Co-AutorInnen:</i> Etemadi, M; Insam, H; Podmirseg, S.M: CoMA 3.0 – The intuitive and user-friendly pipeline for amplicon sequencing data analysis.
International Conference on Biogas Microbiology (ICBM-4), Braga, 09.05.2022. (Weblink)
Einzelvorträge (berufliche Weiterbildung / Wissenstransfer)
Vortrag (Wissenstransfer / Weiterbildung)
- <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, S <i>Co-AutorInnen:</i> Ebner, C; Insam, H: Biomethanisierung von Wasserstoff.
FFG Innovationscamp S - Wasserstofftechnologie, Innsbruck, 21.10.2022. (Weblink)
Publikationen 2021
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Tukanghan, Wisarut; Hupfauf, Sebastian; Gómez-Brandón, María; Insam, Heribert; Salvenmoser, Willi; Prasertsan, Poonsuk; Cheirsilp, Benjamas; O-Thong, Sompong (2021): Symbiotic Bacteroides and Clostridium-rich methanogenic consortium enhanced biogas production of high-solid anaerobic digestion systems.
In: Bioresource Technology Reports 14, Nr. 100685. (DOI) (Weblink)
Vorträge 2021
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Posterpräsentation
- <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, Sebastian <i>Co-AutorInnen:</i> Etemadi, Mohammad; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine Marie: CoMA, an intuitive and user-friendly pipeline for amplicon-sequencing data analysis.
International Symposium on Anaerobic Microbiology 2021 online (ISAM2021 online), Innsbruck, 17.06.2021. (Weblink) - <i>Vortragende/r:</i> Klammsteiner, Thomas <i>Co-AutorInnen:</i> Yalçın, Nazlican; Insam, Heribert; Hupfauf, Sebastian: Frass to gas: industrial insect rearing residues as co-substrates for anaerobic digestion.
INSECTA21 – International Conference, Magdeburg, online, 09.09.2021. (Weblink)
Publikationen 2020
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Hupfauf, S; Etemadi, M; Fernández-Delgado Juárez, M; Gómez-Brandón, M; Insam, H; Podmirseg, S (2020): CoMA – an intuitive and user-friendly pipeline for amplicon-sequencing data analysis.
In: PLoS One 15/12, No. e0243241. (Volltext) (DOI) (Weblink) - Hupfauf, S; Winkler, A; Wagner, A.O; Podmirseg, S.M; Insam, H (2020): Biomethanation at 45 °C offers high process efficiency and supports hygienisation.
In: Bioresource Technology 300, No. 122671. (DOI) (Weblink)
Medienbeiträge
Beitrag in (Web-)Radiosendung
- Kugler, G; Insam, H; Aigner, G; Hupfauf, S; Joshi, A; Vinzelj, J: Die Kleinen mit dem großen Einfluss.
In: Radio Freirad - Verein Freies Radio Innsbruck vom 26.05.2020. (Weblink)
Publikationen 2019
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Walter, Andreas; Probst, Maraike; Franke-Whittle, Ingrid H; Ebner, Christian; Podmirseg, Sabine Marie; Etemadi-Shalamzari, Mohammad; Hupfauf, Sebastian Johannes; Insam, Heribert (2019): Microbiota in anaerobic digestion of sewage sludge with and without co-substrates.
In: Water and Environment Journal 33/2, S. 214 - 222. (Volltext) (DOI) (Weblink)
Vorträge 2019
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Vortrag bei Projektmeeting / Forschungskooperationstreffen
- <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, S <i>Co-AutorInnen:</i> Insam, H; Klammsteiner, T; Masebinu, S; Tonderski, K; Mbohwa, C; Etemadi, M; Podmirseg, S.M.: CoMA – An Intuitive Pipeline for Amplicon Sequencing Data Analysis.
Biogas Research Meeting, Johannesburg, 03.05.2019. (Weblink) - <i>Vortragende/r:</i> Klammsteiner, Thomas <i>Co-AutorInnen:</i> Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert; Masebinu, S.; Tonderski, K.; Mbohwa, C.: Insect Biorefinery-Waste Management with Black Soldier Fly Larvae.
Biogas Research Meeting, Johannesburg, 03.05.2019. (Weblink)
Publikationen 2018
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Hupfauf, S.; Plattner, P.; Wagner, A. O.; Kaufmann, R.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie M. (2018): Temperature shapes the microbiota in anaerobic digestion and drives efficiency to a maximum at 45 °C.
In: Bioresource Technology 269, S. 309 - 318. (DOI) (Weblink)
Vorträge 2018
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Vortrag bei Projektmeeting / Forschungskooperationstreffen
- <i>Vortragende/r:</i> Insam, H. <i>Co-AutorInnen:</i> Masebinu, S.; Hupfauf, S.; Klammsteiner, T.; Fajemilugba, O.; Olanrewanju, D.; Maile, O. L.; Walter, A.; Mbohwa, C.: Improving methane generation and quality of digestate by co-digestion with biochar at 45°C.
South Africa-Austria Joint Researchers´ Closing Workshops, Pretoria, 11.12.2018.
Posterpräsentation
- <i>Vortragende/r:</i> Nagler, Magdalena <i>Co-AutorInnen:</i> Jäger, A; Hupfauf, B; Insam, H; Podmirseg, Sabine Marie: Defining the best pre-treatment method for biomethanisation of sewage sludge and corn straw.
6th International Conference on Sustainable Solid Waste Management, Naxos, 13.06.2018. (Weblink)
Vorträge 2017
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Konferenzvortrag (Invited Plenary / Keynote Lecture)
- <i>Vortragende/r:</i> Insam, Heribert <i>Co-AutorInnen:</i> Wett, Bernhard; Pümpel, Thomas; Nagler, Magdalena; Hupfauf, Sebastian; Tukanghan, Wisarut; Podmirseg, Sabine Marie: Anaerobes and climate.
ISAM 2017 – The 10th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Liblice, 14.06.2017. (Weblink)
Posterpräsentation
- <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, Sebastian <i>Co-AutorInnen:</i> Plattner, P; Insam, H; Podmirseg, Sabine MarieM: Effect of temperature on the anaerobic digestion process.
ISAM 2017 – The 10th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Liblice, 13.06.2017. (Weblink)
Gastvorträge
Gastvortrag
- <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, Sebastian <i>Co-AutorInnen:</i> Insam, Heribert; Plattner, Pia; Podmirseg, Sabine Marie; Mohammad, Etemadi: Improving Methane Generation and Agronomic Quality of Digestate through Co-digestion of Waste-Mixed Sludge and OFMSW: Assessing Digester Internal Process Conditions and Microbial Community.
University of Johannesburg, Johannesburg, 13.12.2017.
Publikationen 2016
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Hupfauf, S.; Bachmann, S.; Fernández-Delgado Juárez, M.; Insam, H.; Eichler-Löbermann, B. (2016): Biogas digestates affect crop P uptake and soil microbial community composition.
In: Science of the Total Environment 542/Part B, S. 1144 - 1154. (DOI)
Publikationen 2015
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Beitrag in Proceedingsband (Abstract)
- Nagler, M.; Jäger, A.; Hupfauf, B.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie (2015): Defining the best pre-treatment method for sewage sludge and corn straw.
In: Fanedl, L., Avgustin, G.: 9th International Symposium on Anaerobic Microbiology (ISAM9). Domzale: Domzale Biotechnical Faculty., ISBN 978-961-6204-71-2, S. 61.
Vorträge 2015
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Posterpräsentation
- <i>Vortragende/r:</i> Nagler, M. <i>Co-AutorInnen:</i> Jäger, A.; Hupfauf, B.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie M.: Defining the best pre-treatment method for sewage sludge and corn straw biomethanisation.
9th International Symposium on Anaerobic Microbiology (ISAM9), Portoroz, 26.06.2015. (Weblink)