Universität Innsbruck

Sebastian Hupfauf, PhD

Postdoc

Institut für Mikrobiologie
Technikerstr. 25d
A-6020 Innsbruck

Bauteil V, 1. Stock, Raum 0/519

Tel.: +43 512 507-51326
Mail: Sebastian.hupfauf@uibk.ac.at

Sebastian Hupfauf

Forschungsgebiete

  • Bioinformatik
  • Anaerobe Vergärung
  • Biogas Produktion
  • Molekulare Ökologie
  • Abwasserepidemiologie
  • Next-Generation Sequencing

Projekte

  • CoMA – Comparative Microbiome Analysis
  • 2strategies4AD - Optimizing anaerobic digestion, a two-strategy approach
  • Pflanzenkohle steigert Biogas Ertrag
  • Phosphor aus Gärresten (Universität Rostock)
  • DeViVa - Deconvolution of Virus Variants
  • Coron-A - Abwassermonitoring für Österreich
  • Teichfilter - Filteranlage für Koiteich

Publikationen

Publikationen 2022

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Amman, F.; Markt, R.; Endler, L; Hupfauf, S.; Agerer, B.; Schedl, A.; Richter, L.; Zechmeister, M.; Bicher, M.; Heiler, G.; Triska, P.; Thornton, M.; Penz, T.; Senekowitsch, M.; Laine, J.; Keszei, Z.; Klimek, P.; Nägele, F.; Mayr, M.; Daleiden, B.; Steinlechner, M.; Niederstätter, H.; Heidinger, P.; Rauch, W.; Scheffknecht, C.; Vogl, G.; Weichlinger, G.; Wagner, AO.; Slipko, K.; Masseron, A.; Radu, E.; Allerberger, F.; Popper, N.; Bock, C.; Schmid, D.; Oberacher, H.; Kreuzinger, N.; Insam, H.; Bergthaler, A. (2022): Viral variant-resolved wastewater surveillance of SARS-CoV-2 at national scale.
    In: Nature Biotechnology 40, S. 1814 - 1822. (DOI) (Weblink)

  • do Carmo Precci Lopes, Alice; Ebner, Christian; Gerke, Frédéric; Wehner, Marco; Robra, Sabine; Hupfauf, Sebastian; Bockreis, Anke (2022): Residual municipal solid waste as co-substrate at wastewater treatment plants: An assessment of methane yield, dewatering potential and microbial diversity.
    In: Science of the Total Environment 804, Nr. 149936. (Volltext) (DOI) (Weblink)

  • Masebinu, SO; Fanoro, OT; Insam, H; Mbohwa, C; Wagner, AO; Markt, R; Hupfauf, S (2022): Can the addition of biochar improve the performance of biogas digesters operated at 45°C?
    In: Environmental Engineering Research 27/2, No. 200648. (DOI) (Weblink)

  • Walter, Andreas; Hanser, Maria; Ebner, Christian; Insam, Heribert; Markt, Rudolf; Hupfauf, Sebastian; Probst, Maraike (2022): Stability of the Anaerobic Digestion Process during Switch from Parallel to Serial Operation—A Microbiome Study.
    In: Sustainability 14/12, No. 7161. (DOI) (Weblink)

Medienbeiträge

Beitrag in Zeitung
  • Hupfauf, S; Etemadi, M; Insam, H; Podmirseg, S.M: DNA-Sequenzierung für Einsteiger und Profis.
    In: Newsroom - www.uibk.ac.at vom 11.02.2022. (Weblink)



Vorträge 2022

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Posterpräsentation
  • <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, S <i>Co-AutorInnen:</i> Amman, F; Insam, H; Wagner, A.O; Markt, R: DeViVa – Deconvolution of Virus Variants.
    Abschlussmeeting Projekt Schulstandortmonitoring, Wien, 30.05.2022.

  • <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, S <i>Co-AutorInnen:</i> Etemadi, M; Insam, H; Podmirseg, S.M: CoMA 3.0 – The intuitive and user-friendly pipeline for amplicon sequencing data analysis.
    International Conference on Biogas Microbiology (ICBM-4), Braga, 09.05.2022. (Weblink)

Einzelvorträge (berufliche Weiterbildung / Wissenstransfer)

Vortrag (Wissenstransfer / Weiterbildung)
  • <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, S <i>Co-AutorInnen:</i> Ebner, C; Insam, H: Biomethanisierung von Wasserstoff.
    FFG Innovationscamp S - Wasserstofftechnologie, Innsbruck, 21.10.2022. (Weblink)



Publikationen 2021

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Tukanghan, Wisarut; Hupfauf, Sebastian; Gómez-Brandón, María; Insam, Heribert; Salvenmoser, Willi; Prasertsan, Poonsuk; Cheirsilp, Benjamas; O-Thong, Sompong (2021): Symbiotic Bacteroides and Clostridium-rich methanogenic consortium enhanced biogas production of high-solid anaerobic digestion systems.
    In: Bioresource Technology Reports 14, Nr. 100685. (DOI) (Weblink)



Vorträge 2021

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Posterpräsentation
  • <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, Sebastian <i>Co-AutorInnen:</i> Etemadi, Mohammad; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine Marie: CoMA, an intuitive and user-friendly pipeline for amplicon-sequencing data analysis.
    International Symposium on Anaerobic Microbiology 2021 online (ISAM2021 online), Innsbruck, 17.06.2021. (Weblink)

  • <i>Vortragende/r:</i> Klammsteiner, Thomas <i>Co-AutorInnen:</i> Yalçın, Nazlican; Insam, Heribert; Hupfauf, Sebastian: Frass to gas: industrial insect rearing residues as co-substrates for anaerobic digestion.
    INSECTA21 – International Conference, Magdeburg, online, 09.09.2021. (Weblink)



Publikationen 2020

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Hupfauf, S; Etemadi, M; Fernández-Delgado Juárez, M; Gómez-Brandón, M; Insam, H; Podmirseg, S (2020): CoMA – an intuitive and user-friendly pipeline for amplicon-sequencing data analysis.
    In: PLoS One 15/12, No. e0243241. (Volltext) (DOI) (Weblink)

  • Hupfauf, S; Winkler, A; Wagner, A.O; Podmirseg, S.M; Insam, H (2020): Biomethanation at 45 °C offers high process efficiency and supports hygienisation.
    In: Bioresource Technology 300, No. 122671. (DOI) (Weblink)

Medienbeiträge

Beitrag in (Web-)Radiosendung
  • Kugler, G; Insam, H; Aigner, G; Hupfauf, S; Joshi, A; Vinzelj, J: Die Kleinen mit dem großen Einfluss.
    In: Radio Freirad - Verein Freies Radio Innsbruck vom 26.05.2020. (Weblink)



Publikationen 2019

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Walter, Andreas; Probst, Maraike; Franke-Whittle, Ingrid H; Ebner, Christian; Podmirseg, Sabine Marie; Etemadi-Shalamzari, Mohammad; Hupfauf, Sebastian Johannes; Insam, Heribert (2019): Microbiota in anaerobic digestion of sewage sludge with and without co-substrates.
    In: Water and Environment Journal 33/2, S. 214 - 222. (Volltext) (DOI) (Weblink)



Vorträge 2019

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Vortrag bei Projektmeeting / Forschungskooperationstreffen
  • <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, S <i>Co-AutorInnen:</i> Insam, H; Klammsteiner, T; Masebinu, S; Tonderski, K; Mbohwa, C; Etemadi, M; Podmirseg, S.M.: CoMA – An Intuitive Pipeline for Amplicon Sequencing Data Analysis.
    Biogas Research Meeting, Johannesburg, 03.05.2019. (Weblink)

  • <i>Vortragende/r:</i> Klammsteiner, Thomas <i>Co-AutorInnen:</i> Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert; Masebinu, S.; Tonderski, K.; Mbohwa, C.: Insect Biorefinery-Waste Management with Black Soldier Fly Larvae.
    Biogas Research Meeting, Johannesburg, 03.05.2019. (Weblink)



Publikationen 2018

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Hupfauf, S.; Plattner, P.; Wagner, A. O.; Kaufmann, R.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie M. (2018): Temperature shapes the microbiota in anaerobic digestion and drives efficiency to a maximum at 45 °C.
    In: Bioresource Technology 269, S. 309 - 318. (DOI) (Weblink)



Vorträge 2018

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Vortrag bei Projektmeeting / Forschungskooperationstreffen
  • <i>Vortragende/r:</i> Insam, H. <i>Co-AutorInnen:</i> Masebinu, S.; Hupfauf, S.; Klammsteiner, T.; Fajemilugba, O.; Olanrewanju, D.; Maile, O. L.; Walter, A.; Mbohwa, C.: Improving methane generation and quality of digestate by co-digestion with biochar at 45°C.
    South Africa-Austria Joint Researchers´ Closing Workshops, Pretoria, 11.12.2018.

Posterpräsentation
  • <i>Vortragende/r:</i> Nagler, Magdalena <i>Co-AutorInnen:</i> Jäger, A; Hupfauf, B; Insam, H; Podmirseg, Sabine Marie: Defining the best pre-treatment method for biomethanisation of sewage sludge and corn straw.
    6th International Conference on Sustainable Solid Waste Management, Naxos, 13.06.2018. (Weblink)



Vorträge 2017

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Konferenzvortrag (Invited Plenary / Keynote Lecture)
  • <i>Vortragende/r:</i> Insam, Heribert <i>Co-AutorInnen:</i> Wett, Bernhard; Pümpel, Thomas; Nagler, Magdalena; Hupfauf, Sebastian; Tukanghan, Wisarut; Podmirseg, Sabine Marie: Anaerobes and climate.
    ISAM 2017 – The 10th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Liblice, 14.06.2017. (Weblink)

Posterpräsentation
  • <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, Sebastian <i>Co-AutorInnen:</i> Plattner, P; Insam, H; Podmirseg, Sabine MarieM: Effect of temperature on the anaerobic digestion process.
    ISAM 2017 – The 10th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Liblice, 13.06.2017. (Weblink)

Gastvorträge

Gastvortrag
  • <i>Vortragende/r:</i> Hupfauf, Sebastian <i>Co-AutorInnen:</i> Insam, Heribert; Plattner, Pia; Podmirseg, Sabine Marie; Mohammad, Etemadi: Improving Methane Generation and Agronomic Quality of Digestate through Co-digestion of Waste-Mixed Sludge and OFMSW: Assessing Digester Internal Process Conditions and Microbial Community.
    University of Johannesburg, Johannesburg, 13.12.2017.



Publikationen 2016

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Hupfauf, S.; Bachmann, S.; Fernández-Delgado Juárez, M.; Insam, H.; Eichler-Löbermann, B. (2016): Biogas digestates affect crop P uptake and soil microbial community composition.
    In: Science of the Total Environment 542/Part B, S. 1144 - 1154. (DOI)



Publikationen 2015

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Beitrag in Proceedingsband (Abstract)
  • Nagler, M.; Jäger, A.; Hupfauf, B.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie (2015): Defining the best pre-treatment method for sewage sludge and corn straw.
    In: Fanedl, L., Avgustin, G.: 9th International Symposium on Anaerobic Microbiology (ISAM9). Domzale: Domzale Biotechnical Faculty., ISBN 978-961-6204-71-2, S. 61.



Vorträge 2015

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Posterpräsentation
  • <i>Vortragende/r:</i> Nagler, M. <i>Co-AutorInnen:</i> Jäger, A.; Hupfauf, B.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie M.: Defining the best pre-treatment method for sewage sludge and corn straw biomethanisation.
    9th International Symposium on Anaerobic Microbiology (ISAM9), Portoroz, 26.06.2015. (Weblink)