Sebastian Hupfauf, PhD
Postdoc
Institut für Mikrobiologie
Technikerstr. 25d
A-6020 Innsbruck
Bauteil V, 1. Stock, Raum 0/519
Tel.: +43 512 507-51326
Mail: Sebastian.hupfauf@uibk.ac.at

Forschungsgebiete
- Bioinformatik
- Anaerobe Vergärung
- Biogas Produktion
- Molekulare Ökologie
- Abwasserepidemiologie
- Next-Generation Sequencing
Projekte
- CoMA – Comparative Microbiome Analysis
- 2strategies4AD - Optimizing anaerobic digestion, a two-strategy approach
- Pflanzenkohle steigert Biogas Ertrag
- Phosphor aus Gärresten (Universität Rostock)
- DeViVa - Deconvolution of Virus Variants
- Coron-A - Abwassermonitoring für Österreich
- Teichfilter - Filteranlage für Koiteich
Lehrveranstaltungen
Publikationen
Liste aller Publikationen
Publikationen 2024
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Suraporn, S.; Cansee, S.; Hupfauf, S.; Klammsteiner, T. (2024): Lactic Acid Bacteria from Bombyx mori Frass: Probiotic Properties and Antagonistic Activities.
In: Agriculture-Basel 14/6, No. 924. (DOI) (Weblink) - Winkler, Jacqueline; Neuner, Thomas; Hupfauf, Sebastian; Arthofer, Anna; Ebner, Christian; Rauch, Wolfgang; Bockreis, Anke (2024): Impact of impeller design on anaerobic digestion: Assessment of mixing dynamics, methane yield, microbial communities and digestate dewaterability.
In: Bioresource Technology 406, Nr. 131095. (DOI) (Weblink)
Beitrag in einem Ausstellungs-/Museumskatalog
- Hupfauf, S.; Wagner, A.; Walter, A.; Wehner, M. (2024): Biogas: Mikroben als grüne Energieproduzenten.
In: Insam, Heribert; Ascher-Jenull, Judith: Science Center MikroMondo – Ein Gruß aus der Küche. Innsbruck: Alpina Druck., ISBN 978-3-900122-28-7, S. 126 - 127. (Weblink)
Vorträge 2024
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Konferenzvortrag (Keynote)
- Vortragende/r: Insam, Heribert Co-AutorInnen: Podmirseg, Sabine Marie; Klammsteiner, Thomas; Hupfauf, Sebastian: Microbes and Climate with a special emphasis on waste management.
11th International Conference on Sustainable Solid Waste Management, Rhodos, 20.06.2024. (Weblink)
Konferenzvortrag
- Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Kleidorfer, Irene; Whittle, Ingrid; Bischof, Daniela; Bockreis, Anke; Insam, Heribert; Müller, Wolfgang; Wehner, Marco: Decentralised system for demand-oriented collection of food waste - assessment of biomethane potential, pathogen development and microbial community structure.
11th International Conference on Sustainable Solid Waste Management, Rhodos, 20.06.2024. (Weblink)
Publikationen 2023
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Steiniger, Bettina; Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert; Schaum, Christian (2023): Exploring Anaerobic Digestion from Mesophilic to Thermophilic Temperatures—Operational and Microbial Aspects.
In: Fermentation-Basel 9/9, Nr. 798. (DOI) (Weblink) - Wehner, Marco; Kleidorfer, Irene; Whittle, Ingrid; Bischof, Daniela; Bockreis, Anke; Insam, Heribert; Müller, Wolfgang; Hupfauf, Sebastian (2023): Decentralised system for demand-oriented collection of food waste – Assessment of biomethane potential, pathogen development and microbial community structure.
In: Bioresource Technology 376, Nr. 128894. (DOI) (Weblink)
Vorträge 2023
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Konferenzvortrag (auf persönliche Einladung)
- Vortragende/r: Insam, H Co-AutorInnen: Markt, R; Wagner, AOW; Nägele, F; Hupfauf, S; Klammsteiner, T; Payr, M; Rauch, W: SARS-CoV-2-Abwassermonitoring und Zukunftsperspektiven.
11. Reichersberger Umwelttag, Reichersberg, 02.03.2023. (Weblink)
Konferenzvortrag
- Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Wehner, Marco; Whittle, Ingrid; Müller, Wolfgang; Kleidorfer, Irene; Insam, Heribert; Bockreis, Anke: Assessment of decentralized food waste storage in a tank system.
ISAM 2023 - 12th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Innsbruck, 24.05.2023. (Weblink) - Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Insam, Heribert; Suraporn, Siripuk; Hupfauf, Sebastian: Frass-tastic additive: Exploring the value of insect frass in anaerobic digestion.
ISAM 2023 - 12th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Innsbruck, 24.05.2023. (Weblink)
Beitrag als Chairperson / SektionsleiterIn / DiskussionsleiterIn / DiskussionsteilnehmerIn
- Hupfauf, Sebastian: Chair of Session 7: Syntrophic models and specific microbial groups.
ISAM 2023 - 12th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Innsbruck, 25.05.2023. (Weblink)
Vortrag bei Expertentagung
- Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Wehner, Marco; Whittle, Ingrid; Müller, Wolfgang; Kleidorfer, Irene; Insam, Heribert; Bockreis, Anke: Dezentrales System zur bedarfsgerechten Sammlung von Speiseabfällen.
Biogas Kongress 2023, Linz, 30.11.2023. (Weblink)
Posterpräsentation
- Vortragende/r: Habel, Magdalena; Wehner, Marco Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Plachot, Julie; Ebner, Christian; Bockreis, Anke; Insam, Heribert: Steigerung der Biogasproduktion durch Umstellung von einem parallelen Betrieb in einen seriellen Betrieb.
Österreichische Abfallwirtschaftstagung: Resilienz der/durch Abfallwirtschaft, Alpbach, 19.04.2023. (Weblink) - Vortragende/r: Pansoni, Caterina; Habel, Magdalena Co-AutorInnen: Plachot, Julie; Ebner, Christian; Insam, Heribert; Bockreis, Anke; Wehner, Marco; Hupfauf, Sebastian: Strategien zur Optimierung der anaeroben Vergärung von Klärschlamm.
Österreichische Abfallwirtschaftstagung: Resilienz der/durch Abfallwirtschaft, Alpbach, 19.04.2023. (Weblink)
Gastvorträge
Gastvortrag
- Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Klammsteiner, Thomas; Plattner, Pia; Winkler, Anna; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine M.: Anaerobic digestion - Aspects of renewable energy and circular economy.
Khon Kaen University, Kohn Kaen, 25.01.2023. (Weblink) - Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Klammsteiner, Thomas; Plattner, Pia; Winkler, Anna; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine M.: Anaerobic digestion - Aspects of renewable energy and circular economy.
Mahasarakham University, Maha Sarakham, 23.01.2023. (Weblink) - Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Heussler, Carina D.; Insam, Heribert; Schlick-Steiner, Birgit C.; Steiner, Florian M: Understanding biotic and abiotic dynamics of black solider fly farming.
Mahasarakham University, Maha Sarakham, 17.01.2023. (Weblink) - Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Heussler, Carina D.; Insam, Heribert; Schlick-Steiner, Birgit C.; Steiner, Florian M.: Industrial insect farming for waste management and insect microbiome research.
Khon Kaen University, Kohn Kaen, 25.01.2023. (Weblink) - Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert: F4G: Frass for gas – an ASEA-UNINET project.
Mahasarakham University, Maha Sarakham, 24.01.2023.
Publikationen 2022
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Amman, F.; Markt, R.; Endler, L; Hupfauf, S.; Agerer, B.; Schedl, A.; Richter, L.; Zechmeister, M.; Bicher, M.; Heiler, G.; Triska, P.; Thornton, M.; Penz, T.; Senekowitsch, M.; Laine, J.; Keszei, Z.; Klimek, P.; Nägele, F.; Mayr, M.; Daleiden, B.; Steinlechner, M.; Niederstätter, H.; Heidinger, P.; Rauch, W.; Scheffknecht, C.; Vogl, G.; Weichlinger, G.; Wagner, AO.; Slipko, K.; Masseron, A.; Radu, E.; Allerberger, F.; Popper, N.; Bock, C.; Schmid, D.; Oberacher, H.; Kreuzinger, N.; Insam, H.; Bergthaler, A. (2022): Viral variant-resolved wastewater surveillance of SARS-CoV-2 at national scale.
In: Nature Biotechnology 40, S. 1814 - 1822. (DOI) (Weblink) - do Carmo Precci Lopes, Alice; Ebner, Christian; Gerke, Frédéric; Wehner, Marco; Robra, Sabine; Hupfauf, Sebastian; Bockreis, Anke (2022): Residual municipal solid waste as co-substrate at wastewater treatment plants: An assessment of methane yield, dewatering potential and microbial diversity.
In: Science of the Total Environment 804, Nr. 149936. (Volltext) (DOI) (Weblink) - Masebinu, SO; Fanoro, OT; Insam, H; Mbohwa, C; Wagner, AO; Markt, R; Hupfauf, S (2022): Can the addition of biochar improve the performance of biogas digesters operated at 45°C?
In: Environmental Engineering Research 27/2, No. 200648. (DOI) (Weblink) - Walter, Andreas; Hanser, Maria; Ebner, Christian; Insam, Heribert; Markt, Rudolf; Hupfauf, Sebastian; Probst, Maraike (2022): Stability of the Anaerobic Digestion Process during Switch from Parallel to Serial Operation—A Microbiome Study.
In: Sustainability 14/12, No. 7161. (DOI) (Weblink)
Medienbeiträge
Beitrag in Zeitung
- Hupfauf, S; Etemadi, M; Insam, H; Podmirseg, S.M: DNA-Sequenzierung für Einsteiger und Profis.
In: Newsroom - www.uibk.ac.at vom 11.02.2022. (Weblink)
Vorträge 2022
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Posterpräsentation
- Vortragende/r: Hupfauf, S Co-AutorInnen: Amman, F; Insam, H; Wagner, A.O; Markt, R: DeViVa – Deconvolution of Virus Variants.
Abschlussmeeting Projekt Schulstandortmonitoring, Wien, 30.05.2022. - Vortragende/r: Hupfauf, S Co-AutorInnen: Etemadi, M; Insam, H; Podmirseg, S.M: CoMA 3.0 – The intuitive and user-friendly pipeline for amplicon sequencing data analysis.
International Conference on Biogas Microbiology (ICBM-4), Braga, 09.05.2022. (Weblink)
Einzelvorträge (berufliche Weiterbildung / Wissenstransfer)
Vortrag (Wissenstransfer / Weiterbildung)
- Vortragende/r: Hupfauf, S Co-AutorInnen: Ebner, C; Insam, H: Biomethanisierung von Wasserstoff.
FFG Innovationscamp S - Wasserstofftechnologie, Innsbruck, 21.10.2022. (Weblink)
Publikationen 2021
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Tukanghan, Wisarut; Hupfauf, Sebastian; Gómez-Brandón, María; Insam, Heribert; Salvenmoser, Willi; Prasertsan, Poonsuk; Cheirsilp, Benjamas; O-Thong, Sompong (2021): Symbiotic Bacteroides and Clostridium-rich methanogenic consortium enhanced biogas production of high-solid anaerobic digestion systems.
In: Bioresource Technology Reports 14, Nr. 100685. (DOI) (Weblink)
Zeitschriftenbeitrag (Meeting-Abstract)
- Klammsteiner, T.; Yalçın, N.; Insam, H.; Hupfauf, S. (2021): Frass to gas: industrial insect rearing residues as co-substrates for anaerobic digestion.
In: Bornimer Agrartechnische Berichte 105, S. 95. (Weblink)
Vorträge 2021
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Posterpräsentation
- Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Etemadi, Mohammad; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine Marie: CoMA, an intuitive and user-friendly pipeline for amplicon-sequencing data analysis.
International Symposium on Anaerobic Microbiology 2021 online (ISAM2021 online), Innsbruck, 17.06.2021. (Weblink) - Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Yalçın, Nazlican; Insam, Heribert; Hupfauf, Sebastian: Frass to gas: industrial insect rearing residues as co-substrates for anaerobic digestion.
INSECTA21 – International Conference, Magdeburg, online, 09.09.2021. (Weblink)
Publikationen 2020
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Hupfauf, S; Etemadi, M; Fernández-Delgado Juárez, M; Gómez-Brandón, M; Insam, H; Podmirseg, S (2020): CoMA – an intuitive and user-friendly pipeline for amplicon-sequencing data analysis.
In: PLoS One 15/12, No. e0243241. (Volltext) (DOI) (Weblink) - Hupfauf, S; Winkler, A; Wagner, A.O; Podmirseg, S.M; Insam, H (2020): Biomethanation at 45 °C offers high process efficiency and supports hygienisation.
In: Bioresource Technology 300, No. 122671. (DOI) (Weblink)
Medienbeiträge
Beitrag in (Web-)Radiosendung
- Kugler, G; Insam, H; Aigner, G; Hupfauf, S; Joshi, A; Vinzelj, J: Die Kleinen mit dem großen Einfluss.
In: Radio Freirad - Verein Freies Radio Innsbruck vom 26.05.2020. (Weblink)
Publikationen 2019
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Walter, Andreas; Probst, Maraike; Franke-Whittle, Ingrid H; Ebner, Christian; Podmirseg, Sabine Marie; Etemadi-Shalamzari, Mohammad; Hupfauf, Sebastian Johannes; Insam, Heribert (2019): Microbiota in anaerobic digestion of sewage sludge with and without co-substrates.
In: Water and Environment Journal 33/2, S. 214 - 222. (Volltext) (DOI) (Weblink)
Vorträge 2019
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Vortrag bei Projektmeeting / Forschungskooperationstreffen
- Vortragende/r: Hupfauf, S Co-AutorInnen: Insam, H; Klammsteiner, T; Masebinu, S; Tonderski, K; Mbohwa, C; Etemadi, M; Podmirseg, S.M.: CoMA – An Intuitive Pipeline for Amplicon Sequencing Data Analysis.
Biogas Research Meeting, Johannesburg, 03.05.2019. (Weblink) - Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert; Masebinu, S.; Tonderski, K.; Mbohwa, C.: Insect Biorefinery-Waste Management with Black Soldier Fly Larvae.
Biogas Research Meeting, Johannesburg, 03.05.2019. (Weblink)
Publikationen 2018
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Hupfauf, S.; Plattner, P.; Wagner, A. O.; Kaufmann, R.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie M. (2018): Temperature shapes the microbiota in anaerobic digestion and drives efficiency to a maximum at 45 °C.
In: Bioresource Technology 269, S. 309 - 318. (DOI) (Weblink)
Vorträge 2018
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Vortrag bei Projektmeeting / Forschungskooperationstreffen
- Vortragende/r: Insam, H. Co-AutorInnen: Masebinu, S.; Hupfauf, S.; Klammsteiner, T.; Fajemilugba, O.; Olanrewanju, D.; Maile, O. L.; Walter, A.; Mbohwa, C.: Improving methane generation and quality of digestate by co-digestion with biochar at 45°C.
South Africa-Austria Joint Researchers´ Closing Workshops, Pretoria, 11.12.2018.
Posterpräsentation
- Vortragende/r: Nagler, Magdalena Co-AutorInnen: Jäger, A; Hupfauf, B; Insam, H; Podmirseg, Sabine Marie: Defining the best pre-treatment method for biomethanisation of sewage sludge and corn straw.
6th International Conference on Sustainable Solid Waste Management, Naxos, 13.06.2018. (Weblink)
Vorträge 2017
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Konferenzvortrag (Keynote)
- Vortragende/r: Insam, Heribert Co-AutorInnen: Wett, Bernhard; Pümpel, Thomas; Nagler, Magdalena; Hupfauf, Sebastian; Tukanghan, Wisarut; Podmirseg, Sabine Marie: Anaerobes and climate.
ISAM 2017 – The 10th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Liblice, 14.06.2017. (Weblink)
Posterpräsentation
- Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Plattner, P; Insam, H; Podmirseg, Sabine MarieM: Effect of temperature on the anaerobic digestion process.
ISAM 2017 – The 10th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Liblice, 13.06.2017. (Weblink)
Gastvorträge
Gastvortrag
- Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Insam, Heribert; Plattner, Pia; Podmirseg, Sabine Marie; Mohammad, Etemadi: Improving Methane Generation and Agronomic Quality of Digestate through Co-digestion of Waste-Mixed Sludge and OFMSW: Assessing Digester Internal Process Conditions and Microbial Community.
University of Johannesburg, Johannesburg, 13.12.2017.
Publikationen 2016
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
- Hupfauf, S.; Bachmann, S.; Fernández-Delgado Juárez, M.; Insam, H.; Eichler-Löbermann, B. (2016): Biogas digestates affect crop P uptake and soil microbial community composition.
In: Science of the Total Environment 542/Part B, S. 1144 - 1154. (DOI)
Publikationen 2015
Beiträge in Büchern / Zeitschriften
Beitrag in Proceedingsband (Abstract)
- Nagler, M.; Jäger, A.; Hupfauf, B.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie (2015): Defining the best pre-treatment method for sewage sludge and corn straw.
In: Fanedl, L., Avgustin, G.: 9th International Symposium on Anaerobic Microbiology (ISAM9). Domzale: Domzale Biotechnical Faculty., ISBN 978-961-6204-71-2, S. 61.
Vorträge 2015
Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.
Posterpräsentation
- Vortragende/r: Nagler, M. Co-AutorInnen: Jäger, A.; Hupfauf, B.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie M.: Defining the best pre-treatment method for sewage sludge and corn straw biomethanisation.
9th International Symposium on Anaerobic Microbiology (ISAM9), Portoroz, 26.06.2015. (Weblink)