Salcher M.M., Layoun P., Fernandes C., Chiriac M.-C., Bulzu P.-A., Ghai R., Shabarova T., Lanta V., Callieri C., Sonntag B., Posch T., Lepori F., Znachnor P., Haber M. (2025). Bringing the uncultivated microbial majority of freshwater ecosystems into culture. Nat Communications 16: 7971, https://doi.org/10.1038/s41467-025-63266-9
Ein internationales Forschungsteam, unter Leitung von Michaela Salcher vom Institut für Hydrobiologie der Tschechischen Akademie der Wissenschaften und Bettina Sonntag vom Forschungsinstitut in Mondsee, hat erstmals einen großen Teil der bislang nicht kultivierbaren Mikroorganismen aus Süßwasser-Ökosystemen in Reinkultur gebracht. Mit einer Hochdurchsatz-Methode („dilution-to-extinction“) und speziell entwickelten Nährmedien isolierten die Wissenschaftler:innen 627 axenische Stämme aus 14 mitteleuropäischen Seen. Darunter befinden sich Vertreter von 15 der 30 weltweit häufigsten Bakteriengattungen in Süßwasser – viele von ihnen waren bisher nur aus DNA-Daten bekannt.
In der neuen Kultursammlung, die zahlreiche langsam wachsende, genomsparsame Oligotrophe beinhaltet, wird von den Autor:innen eine Klassifizierung mehrerer neuer Familien, Gattungen und Arten vorgeschlagen. Sie bietet erstmals Modellorganismen für dominierende, aber bislang unerforschte Mikroorganismen, die eine Schlüsselrolle in Stoffkreisläufen von Seen spielen.
Diese Forschung wurde von der Tschechischen Wissenschaftsstiftung und der Universität von Südböhmen unterstützt.